РАзница только в контроллере, т.е. в плате которая стоит на жестком диске, срок службы примерно одинаковый, ну сата еще побыстрее будут при чтении из буфера жесткого диска, что не очень принципиально, вобщем можешь брать любой, единственное если будешь раид массив делать то лучше сата так как во все материнки контроллер раид восновном встроен.